V médiích se od 21. března 2017 objevila informace, že „Evropská komise zjistila pochybení při rozdělování dotací holdingu AGROFERT“. Tuto nepravdivou a zavádějící zprávu jednoho z internetových serverů následně převzala celá řada českých médií, a to včetně veřejnoprávního Českého rozhlasu.
Koncern AGROFERT se proti takovým nařčením musí ohradit. Nejsou založena na pravdě, mají manipulativní charakter a politický podtext ve vztahu k bývalému akcionáři.
Podrobné vysvětlení celé problematiky sdělení Evropské komise je k dispozici ve vyjádření Státního zemědělského a intervenčního fondu.
Aktualizace 31. 8. 2018: dle vyjádření Evropské komise nedošlo k žádnému pochybení. Celá kauza pouze rezonovala v médiích a měla politický podtext. S informací přišel server Novinky.cz.